Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Syde1Q9DBZ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Syde1Q9DBZ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Syde1Q9DBZ9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms