Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Swt1Q9DBQ9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Swt1Q9DBQ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Swt1Q9DBQ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Swt1Q9DBQ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms