Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBH5

Lman2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman2Q9DBH5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lman2Q9DBH5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2Q9DBH5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lman2Q9DBH5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lman2Q9DBH5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lman2Q9DBH5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lman2Q9DBH5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms