Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cmtr1Q9DBC3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cmtr1Q9DBC3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cmtr1Q9DBC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cmtr1Q9DBC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms