Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc54Q9DAL3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc54Q9DAL3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms