Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samd8Q9DA37 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Samd8Q9DA37 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Samd8Q9DA37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms