Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atg7Q9D906 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atg7Q9D906 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atg7Q9D906 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms