Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Y0

Efhd2, EF-hand domain-containing protein D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd2Q9D8Y0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efhd2Q9D8Y0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efhd2Q9D8Y0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efhd2Q9D8Y0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efhd2Q9D8Y0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms