Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tvp23bQ9D8T4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tvp23bQ9D8T4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms