Protein–RNA interactions for Protein: Q9D706

Rpap3, RNA polymerase II-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap3Q9D706 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap3Q9D706 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap3Q9D706 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap3Q9D706 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpap3Q9D706 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpap3Q9D706 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpap3Q9D706 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpap3Q9D706 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms