Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tube1Q9D6T1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tube1Q9D6T1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tube1Q9D6T1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tube1Q9D6T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms