Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sdr42e1Q9D665 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sdr42e1Q9D665 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdr42e1Q9D665 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdr42e1Q9D665 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms