Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lpcat2bQ9D5U0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lpcat2bQ9D5U0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms