Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930449I24RikQ9D5E3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930449I24RikQ9D5E3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms