Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc130Q9D516 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc130Q9D516 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc130Q9D516 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms