Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Syce1Q9D495 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syce1Q9D495 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce1Q9D495 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce1Q9D495 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms