Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D454 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D454 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D454 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D454 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D454 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D454 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D454 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D454 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D454 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D454 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D454 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D454 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D454 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D454 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D454 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D454 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D454 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D454 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D454 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q9D454 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D454 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D454 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D454 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D454 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q9D454 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D454 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D454 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D454 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D454 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D454 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q9D454 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q9D454 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q9D454 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q9D454 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D454 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D454 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q9D454 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q9D454 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q9D454 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q9D454 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D454 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D454 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D454 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D454 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D454 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q9D454 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D454 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D454 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D454 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q9D454 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms