Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fsip1Q9D3V5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fsip1Q9D3V5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fsip1Q9D3V5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms