Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc6bQ9D289 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Trappc6bQ9D289 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc6bQ9D289 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc6bQ9D289 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms