Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cthrc1Q9D1D6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cthrc1Q9D1D6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cthrc1Q9D1D6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cthrc1Q9D1D6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms