Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Susd3Q9D176 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Susd3Q9D176 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Susd3Q9D176 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Susd3Q9D176 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms