Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc167Q9D162 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc167Q9D162 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc167Q9D162 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms