Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prpsap1Q9D0M1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpsap1Q9D0M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms