Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0K1

Pex13, Peroxisomal membrane protein PEX13, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex13Q9D0K1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pex13Q9D0K1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pex13Q9D0K1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pex13Q9D0K1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms