Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F4

Nkap, NF-kappa-B-activating protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NkapQ9D0F4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NkapQ9D0F4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NkapQ9D0F4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NkapQ9D0F4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NkapQ9D0F4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms