Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT5

Vasn, Vasorin, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VasnQ9CZT5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VasnQ9CZT5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VasnQ9CZT5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VasnQ9CZT5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VasnQ9CZT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VasnQ9CZT5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VasnQ9CZT5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms