Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc18Q9CZJ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnajc18Q9CZJ9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dnajc18Q9CZJ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc18Q9CZJ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms