Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Mis18aQ9CZJ6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mis18aQ9CZJ6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mis18aQ9CZJ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mis18aQ9CZJ6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms