Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY50

Ssr1, Translocon-associated protein subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr1Q9CY50 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ssr1Q9CY50 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ssr1Q9CY50 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssr1Q9CY50 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms