Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx7Q9CY18 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Snx7Q9CY18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snx7Q9CY18 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms