Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rpl11Q9CXW4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rpl11Q9CXW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rpl11Q9CXW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms