Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RpainQ9CWY9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RpainQ9CWY9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RpainQ9CWY9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms