Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpusd4Q9CWX4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd4Q9CWX4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms