Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pin4Q9CWW6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pin4Q9CWW6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pin4Q9CWW6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pin4Q9CWW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pin4Q9CWW6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pin4Q9CWW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pin4Q9CWW6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pin4Q9CWW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms