Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CWU4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CWU4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CWU4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CWU4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CWU4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CWU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CWU4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CWU4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CWU4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CWU4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CWU4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CWU4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CWU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CWU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CWU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q9CWU4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q9CWU4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CWU4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CWU4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CWU4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Q9CWU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CWU4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CWU4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CWU4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q9CWU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q9CWU4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q9CWU4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9CWU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CWU4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms