Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWK8

Snx2, Sorting nexin-2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx2Q9CWK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx2Q9CWK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx2Q9CWK8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snx2Q9CWK8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 523.9 ms