Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atxn3Q9CVD2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atxn3Q9CVD2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atxn3Q9CVD2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atxn3Q9CVD2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms