Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sppl3Q9CUS9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sppl3Q9CUS9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl3Q9CUS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sppl3Q9CUS9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms