Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smc1aQ9CU62 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smc1aQ9CU62 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smc1aQ9CU62 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smc1aQ9CU62 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms