Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rhobtb3Q9CTN4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhobtb3Q9CTN4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms