Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pard3bQ9CSB4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pard3bQ9CSB4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pard3bQ9CSB4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms