Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5sQ9CRA7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp5sQ9CRA7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms