Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl28Q9CR40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl28Q9CR40 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klhl28Q9CR40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl28Q9CR40 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms