Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR21

Ndufab1, Acyl carrier protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufab1Q9CR21 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndufab1Q9CR21 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufab1Q9CR21 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufab1Q9CR21 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms