Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PsenenQ9CQR7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PsenenQ9CQR7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PsenenQ9CQR7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms