Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Chchd5Q9CQP3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chchd5Q9CQP3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chchd5Q9CQP3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms