Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccer1Q9CQL2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccer1Q9CQL2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccer1Q9CQL2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms