Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rdm1Q9CQK3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rdm1Q9CQK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rdm1Q9CQK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rdm1Q9CQK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms