Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd2aQ9CQJ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd2aQ9CQJ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd2aQ9CQJ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms