Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed6Q9CQG0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed6Q9CQG0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed6Q9CQG0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms